过去认为，大多数慢性肾盂肾炎由急性肾盂肾炎治疗不彻底反复发作而致。近年来，对于二者之间的关系有了新认识，认为两者之间关系并不象以前所说的那样重要，对于慢性肾盂肾炎的诊断标准已有所修正。
据文献报告，本病占全部肾盂肾炎的7%～20%，仅半数病人有急性肾盂肾炎的发作史。本病临床表现复杂，症状多端。其主要表现是真性细菌尿，尿中仅有少量白细胞和蛋白，细菌尿可为持续或间歇性。患者多有反复发作的尿路刺激症状。慢性肾盂肾炎临床表现：
症状：小儿（偶尔成人）患者可出现慢性细菌性肾盂肾炎的急性发作。发热仅见于急性发作期，无急性发作的患者可能无症状。当慢性肾盂肾炎进入晚期且累及双侧肾脏时，可出现高血压、贫血和氮质血症的相关症状。
实验室检查：在无急性感染发作或氮质血症的情况下，血液检查通常正常。尿液分析结果取决于是否有活动性感染和肾损害的严重程度，仅在部分病例中可发现脓尿和菌尿。
明显的蛋白尿则意味着病情严重，病变累及到肾小球。如果有菌尿症，则尿培养阳性，根据病情的不同阶段，血清肌酐和血尿素氮可以正常或升高。
X线检查：腹部平片可见一侧或双侧肾脏缩小，且不规则。有时可见尿路结石。尿路造影可发现慢性肾盂肾炎的特征性表现，如肾盂扩张，以及其表面肾实质瘢痕形成或萎缩，肾实质变形，造影剂显影不良和显影延迟。
在单侧萎缩性肾盂肾炎，其对侧肾脏代偿性扩大。如有膀胱输尿管返流，则出现输尿管扩张。逆行尿路造影亦可见相似的表现，逆行膀胱尿道造影可发现膀胱输尿管返流，尤其是儿童患者更为常见。
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